1944年,哈里森·福特饰演的琼斯协助他的同事对抗纳粹分子尤尔根佛勒,成功夺得了半个安提基特拉机械的神秘表盘。这个表盘可以让人穿越时空,回到他们想要去的年代。25年后,已经退休的考古学家琼斯正准备过上平静稳定的生活,但他的干女儿海伦娜突然出现,要求他参与寻找一件古代遗物,这个遗物足以破坏现代的和平。为了保护世界,琼斯被迫再次踏上冒险之旅。乔纳斯·泰勒(杰森·斯坦森 饰)与科学家张九溟(吴京 饰)双雄联手,进入海底7000米深渊执行探索任务。他们意外遭遇史前巨兽海洋霸主巨齿鲨群的攻击,还将对战凶猛危险的远古怪兽群。